7 квітня 1848 року група студентів на чолі з ліберальним націоналістичним активістом і поетом Ловро Томаном підняла перший словенський прапор у Любляні. Австрійська влада прийняла його як офіційний прапор Карніоли, незважаючи на сильну опозицію з боку Німеччини. Австрійський уряд загалом придушував ненімецькі емблеми по всій імперії, але це регіональне визнання було винятком.
Побоюючись, що прапори з більш ніж трьома кольорами можуть спровокувати повстання, австрійський центральний уряд наказав, щоб регіональні прапори та прапор імперії були обмежені двома кольорами кожен. Тому словенський народ дуже зрадів, коли карніоланський триколор - білий, синій і червоний - був офіційно прийнятий як символ Об'єднаної Словенії. У якийсь момент у другій половині ХІХ століття словенський триколор витіснив за значенням усі інші національні символи.

Навіть після того, як Словенія стала частиною Югославії з прапором із синім кольором у верхній частині, прапор з його яскравими кольорами все ще був легко впізнаваним. Хоча він був заборонений, а його користувачі були покарані фашистським урядом, його використовували словенці Юліанського маршу, які були підкорені Італією в міжвоєнний період. Герб Словенії, розроблений Марко Поганіком, був офіційно прийнятий після того, як країна проголосила свою свободу від Югославії. 27 червня 1991 року після багато місячних дискусій щодо герба нової республіки було обрано прапор.