Першими європейцями, які відвідали Тонга, були голландські мореплавці Якоб Лемер і Віллем Схаутен у 1616 році під час своєї подорожі через Тихий океан. Пізніше, у 1643 році, острів відвідав інший голландський дослідник, Абель Тасман, який зробив перші офіційні записи про регіон, хоча контакти між європейцями та місцевими жителями в той час були обмеженими. У 1773 році британський дослідник Джеймс Кук відвідав Тонга під час своєї другої експедиції до Тихого океану, а згодом повторно у 1774 та 1777 роках. Він назвав архіпелаг «Островами дружби» через теплий прийом, який отримав від місцевих жителів. Завдяки європейським дослідникам, таким як Лемер, Схаутен, Тасман і Кук, Тонга стала відомою за межами Океанії, що згодом сприяло налагодженню тісних контактів із західним світом і появі перших державних символів.

Першим королем сучасної Тонги вважається “Tāufaʻahau I”, який під час хрещення отримав ім'я “Siaosi” на честь короля Великої Британії Джорджа III. Джордж Тупу I хотів створити прапор як символ єдності свого королівства. Центральним елементом прапора є літери «M» (синя) та «A» (червона), які, як вважається, символізують короля Джорджа Тупоу I (його народне ім'я - « Siaosi Taufaʻahau»). Ліворуч від літер розташовані два синіх хрести, а праворуч - два червоних, що символізують християнство і жертовність, боротьбу за віру і королівську владу, відповідно. Прапор був символом правління короля Тупу I на головному острові Тонга - Тонгатапу - в період, коли він намагався об'єднати країну під єдиною адміністрацією, але в 1862 році він був замінений.

Між 1862 і 1866 роками Тонга використовувала свій перший офіційний національний прапор, затверджений королем Джорджем Тупу I. Прапор складався з червоного хреста на білому тлі, де хрест символізував Ісуса Христа, червоний колір його кров, а білий колір - чистоту і мир. Однак через кілька років, вже у 1866 році, прапор було змінено, оскільки Джордж Тупу І продовжував адаптувати державну символіку відповідно до нових потреб і сподівань. Це було пов'язано з закріпленням християнства в державі, зміцненням міжнародних зв'язків та подальшими реформами.
Сучасний прапор Тонги був офіційно прийнятий 4 листопада 1875 року та складається з червоного полотнища із білим квадратом у верхньому лівому куті (кантоні), на якому зображений червоний хрест. Важливо зазначити, що в 1875 році цей прапор був закріплений конституційно, і відповідно до законів Тонги, він не може бути змінений. Тонга є однією з небагатьох країн світу, де державний прапор залишається незмінним протягом більш ніж століття.