Історія бельгійського прапора тісно пов'язана зі становленням і незалежністю Бельгії як держави. Його витоки можна простежити до Бельгійської революції 1830 року, яка принесла Бельгії незалежність від Королівства Нідерландів.
У перші дні революції, в серпні 1830 року, в Брюсселі було піднято червоно-жовто-чорний прапор у відповідній послідовності. Ці кольори були розташовані горизонтально, натхненні прапором Брабантської революції 1789 року, який мав ті ж кольори, але дещо іншу послідовність, а саме червоний, чорний, жовтий. Однак незабаром цей стиль змінився на вертикальний формат, схожий на французький прапор, але з бельгійськими кольорами.

Самі кольори походять від герба герцогства Брабант, на якому зображений золотий (жовтий) лев на чорному тлі, з червоними кігтями та язиком. Ці кольори були прийняті як символ революції та незалежності.
Сучасний варіант прапора з чорною, жовтою та червоною вертикальними смугами був офіційно затверджений 23 січня 1831 року. З того часу, незважаючи на політичну нестабільність країни та мовну напруженість, прапор залишається незмінним.