До 1990 року Ємен був розділений на Північний Ємен і Південний Ємен, кожен з яких мав свій прапор.

Прапор Ємену в північній частині
Після проголошення незалежності північної частини Ємену та її відокремлення від Османської імперії було створено Єменське Мутаваккілітське королівство з прапором на червоному тлі з 5 білими зірками та шаблею. Це було між 1927 і 1962 роками, а починаючи з цієї дати, в північній частині за підтримки Єгипту спалахнула революція, що призвела до створення Єменської Арабської Республіки і нового прапора: три горизонтальні лінії червоного, білого і чорного кольорів і зелена зірка посередині білої смуги.
Прапор Ємену в південній частині
У 1967 році націоналістичні сили, подібні до тих, що діяли на півночі, досягли успіху в південній частині Ємену і змогли повалити британське правління та проголосити республіку. Південний Ємен проіснував доти, доки 30 листопада 1967 року офіційно не став Народною Демократичною Республікою Ємен, і його прапор також мав ті ж три кольори: червоний, білий і чорний, але з синім трикутником на лівій стороні прапора, схожим на прапор Чеської Республіки, і червоною зіркою посередині трикутника.
Прапор Ємену після об’єднання
У 1990 році Північний і Південний Ємен були об'єднані під одним урядом і назвою Єменська Республіка. Оскільки різниця між північним і південним прапорами полягала лише в символіці, об'єднаний прапор набув вигляду червоно-біло-чорного триколора з вилученням додаткових елементів, таких як зірка і трикутник. Цей прапор залишився незмінним до сьогоднішнього дня.