Близько 1498 року європейські поселенці зіткнулися з гайанськими землями, які раніше були заселені араваками та карибами. Першими колоністами були голландці, тому їхні прапори мали голландську символіку. Першою колонією стала Ессекібо, заснована в 1616 році. Пізніше з'явилися ще дві колонії: Бербіс у 1627 році та Демерара у 1773 році. Цими колоніями керувала голландська Вест-Індська компанія, яка мала власний прапор з червоно-біло-синіми кольорами. Пізніше британським емігрантам з інших карибських колоній також було дозволено в'їзд до Гайани, і Демерара стала основним місцем їхнього поселення. У 1781 році голландські колонії були захоплені британцями.
Гайана протягом багатьох років переживала конфлікти і зміни влади на своїй території. У 1804 році британський суверенітет над колоніями збільшувався, що призвело до бажання розширити свій вплив на річку Ессекібо, яка належала Венесуелі. У 1835 році було встановлено кордон між Британською Гвіаною та Венесуелою, який проходив по річці Оріноко. Частина території Венесуели була окупована британцями, і підрозділи їхньої армії продовжують претендувати на цю територію і сьогодні. Британські колоніальні прапори з'явилися в Гайані в 1875 році.
Прапор колонії, який використовувався до 1906 року, мав темно-синє тло з Юніон Джеком у кутку і колоніальним гербом праворуч. Герб був округлої форми і зображував корабель з вітрилами, що пливе по морю з хвилями. У 1906 році відбулася перша модифікація прапора, в результаті якої коричневі гори з заднього плану були прибрані, а небо стало блакитно-білим. Герб став овальним із золотисто-жовтим написом "Віддавай і чекай натомість". У 1919 році було вирішено прибрати біле коло навколо герба і розмістити його безпосередньо на синьому тлі прапора.
Після політичних змін у 1955 році на прапорі з'явилося кругле коло з гербом у центрі, що відображає незалежність колонії. Змінився дизайн корабля, зменшилася кількість вітрил, а колір корабля став золотисто-коричневим. Жовта стрічка з девізом колонії була замінена на новий прапор Гайани. Рух за незалежність набирав обертів, а ідея вільної Гайани поширювалася. У 1960 році американський вексилолог Вітні Сміт розробив новий дизайн прапора Гайани. Новий прапор Гайани переміг у конкурсі, але прийняття прапора і здобуття незалежності зайняло кілька років. Уряд Гайани запросив Вітні Сміта на святкування Дня незалежності в Джорджтаун.
Прапор Гайани був офіційно прийнятий в 1966 році і з тих пір не змінювався. Він складається із зеленого прямокутника з жовтим трикутником по лівій стороні прапора. На жовтому трикутнику розміщений червоний рівносторонній трикутник з чорним контуром. Обидва трикутники мають спільну основу, але їхні вершини не збігаються. Прапор Гаяни представляє національну ідентичність країни і символізує свободу та автономію, надану урядом.
